苗医认为，毒、亏、伤、积、菌、虫是导致人体生病的六种因素，简称六因。诊断疾病是通过把脉、听声、观察颜色、询问病情，用手触、摸、扣、打、刮、按、搬、量等传统方法，来观察人体形态结构的变化和精神方面的异常情况。
苗医用药多是植物药、动物药及少量矿物药。药的特征归纳起来有热、冷和不热不冷三种；热药可治冷病，冷药可治热病，和药可补体质、治亏损病。据不完全统计，目前常见的药可达1500种之多，常用的约200种。
苗药主要分布于苗族聚居的苗岭山脉、乌蒙山脉及武陵山脉等地区。由于各地区纬度、地理环境、用药习惯的不同，各类药物分布有差异，有的种类如：见血飞、鱼腥草、银花、桔梗等几乎各地都有分布；而有的种类如：艾纳香、马槟榔、金铁锁、松萝、紫金莲等仅限于某些地区和一定的海拔高度才有分布。近年来，我国苗族聚居的广大地区建立了不少的药材种植生产基地，大力开发常用的药材如天麻、茯苓、杜仲等的人工栽培。
